Το Μαργαριτσανό φαράγγι στον νομό Ρεθύμνου βρίσκεται κοντά στο χωριό Μαργαρίτες και απέχει 30 περίπου χιλιόμετρα από την πόλη του Ρεθύνου.
Είναι σχηματισμένο από πετρώματα ασβεστόλιθου 8-10 εκατομμυρ. χρόνων ως αποτέλεσμα της σταδιακής ανύψωσης όλης της περιοχής και της διάβρωσης του νερού και γεμάτο από μεγάλη ποικιλία πανίδας και χλωρίδας, όπως κυπαρίσσια, χαμηλούς θάμνους, αγριολούλουδα και αρωματικά φυτά. Γενικότερα μικρές πεζοπορικές διαδρομές, σχεδιασμένες από τις Δημοτικές Αρχές της περιοχής βοηθούν τον επισκέπτη να γνωρίσει καλύτερα την περιοχή.